Smrz le plus rapide à domicile
Le pilote local a pris le dessus sur Max Biaggi (Aprilia Alitalia Racing Team) et a imposé un écart de 0.171 sec.
La troisième place de ces essais revient à Marco Melandri (Yamaha World Superbike Team). L'Italien se montre très à l'aise à Brno, et devance Michel Fabrizio (Suzuki Alstare) et l'autre Effenbert-Liberty Racing Ducati de Sylvain Guintoli.
Le leader du championnat Carlos Checa (Althea Racing Ducati) a réalisé le septième meilleur chrono, entre Leon Camier (Aprilia Alitalia Racing Team), sixième, et Haslam (BMW Motorrad Motorsport), au huitième rang.
Le Britannique Toseland (BMW Motorrad Italia SBK Team), de retour suite à sa blessure, a tourné dans le 18ème chrono, tandis que Chris Vermeulen (Kawasaki Racing Team) a chuté dans son tour de sortie et s'est de nouveau touché à l'épaule.